十七世纪英国政治思想家约翰?洛克认为，在君主专制政体下，对个人权利造成最大伤害的却往往是国家权力，他认为人们若把财产交给专制君主来保护，便是无异于为了防止狐狸的骚扰而甘愿为狮子吞食，出现这种现象的原因就是君主政体下政府的权力过分集中，缺乏对权力的制约，为了防范政府超出人们对它的授权，更好地保护人们的权利，分权便是必要的了。
朱元璋进行的权力整顿运动可以说是官家制度的重大变革，这项以强化皇权为目的变革是中国政治史上的一件大事。与皇权较劲了一千五百多年的相权就这样在朱元璋手里化为无形，这也开启了明清两代五百多年的官家权力新格局。
虽然废除宰相制度，让他的工作量翻了几番，他甚至感觉到了力不从心，但他从没有想过再度恢复宰相制度。前朝的前车之鉴摆在那里，朱元璋不能不有所警醒，每次皇权与相权博弈之后，当皇权取得主动，皇帝为了分流相权，往往会让自己的官家系统生出新的权力枝节，也就是新的辅政机构。这就形成了权力的恶性循环。在每一次循环过程中因为新的权力危机，不是宦官（太监）干政，就是皇亲国戚篡权。我们可以统计一下，历史上哪一次宦官专权不是由开国君主为了加强皇权引发了祸端，自己美滋滋得了现实利益，报应却落在后辈中的无能者身上。不是被宦官专权，就是引发朝纲混乱，权力易主。朱元璋对废相后面临的权力困境还是认识不够，可他并不愿意在历史的铁律面前乖乖就范。他要走出一条权力的新路，一条可以打响其个人品牌的道路。
既然要推倒一切重来来过，那就索性闹他个天翻地覆。
朱元璋以此为由头，对新帝国的官吏队伍进行了大张旗鼓的大清洗。除了朱元璋本人，谁也未曾料到这样的一场清洗方式会以如此暴烈的方式。
朱元璋在杀伐决断上绝对够得上一名快刀手，只要他感到不快或者不安时，他会毫不犹豫地出手，而且出手的频率是快如闪电的。快过小李飞刀的刀。
但是，让人不解的是他在对待胡惟庸的问题上却是另外一番情形，纵容，再纵容。甚至在长达十多年时间里，胡惟庸在朱元璋的权力结构中都是一人独揽大权。即一个人当丞相，时称“独相”。但是对其他人朱元璋却缺乏足够的耐心，要知道在胡惟庸前面垮台的那些人中，常遇春、徐达、刘伯温诸人的地位与威望又有谁不曾超越胡惟庸？可这根本挡不住朱元璋清洗的脚步。
为什么说朱元璋这个快刀手对胡惟庸表现出了足够的忍耐，甚至是纵容。让我们拿李善长与其比较一下，李善长是朱元璋的“大管家”，和朱元璋有老乡和亲家的双层关系，在中国这样一个讲究“地缘效应”的官僚体系中，朱元璋连他都不能够做到完全信任，又能信任谁？曾经被朱元璋比喻为自己身边的萧何，是公认的大明王朝第一开国功臣，在军民中的声望可谓一时无两。可就是这样一个人，朱元璋在给予他崇高赞誉之后，偏偏不让他继续做丞相。
李善长在58岁时就被朱元璋强迫退休回家抱孙子，77岁时又被拉进胡惟庸奸党案。朱元璋一口气杀掉其全家70多口人，只赦免了他的女儿和女婿。赦免主要是因为他们是驸马和公主。与李善长居于同等位置的还有刘伯温，刘伯温的才干、品性与威信也远在胡惟庸者流之上，被朱元璋比喻为自己的张良，朱元璋也同样不让他做丞相。朱元璋是铁了心要将那个可能会在宰相这个位置上折腾出动静的胡惟庸推向权力的前台。
朱元璋这么做，也就难怪会有人认为。他需要胡惟庸这样一个权欲熏心、并可能利令智昏的人物，需要他替自己清除障碍，如消灭刘伯温。他还需要这个人闹出点大动静，为自己提供一个端掉丞相制度的理由。这个理由是给官僚集团和天下百姓看的，不过是掩耳盗铃罢了。
这盘棋从一开始就完全落入了朱元璋个人独裁的掌控之中，不出手则已，出手则会要人的命。
废除丞相制度，朱元璋对帝国的权力结构进行了重大改组。也就是前面说到过的，由六部和监察机关分食相权这块大蛋糕，皇帝总领全局。 为了将这种制度延续下去，朱元璋在《皇明祖训》中留下一句极为酷烈的话：后代有敢建议立宰相者，灭九族。
这种权力系统的设置与前朝的官僚体系相比，最大的特点就是简单透明，透明是为了方便皇帝能够对庞大繁杂的权力结构一览无遗。所有的权力全部被皇帝划拉到口袋里，即所谓“大权一归朝廷”。朱元璋这么做就是逼着自己的子孙们不要偷懒，对待自己的家族企业要做到亲力亲为。此项制度在各种因素的交互作用下，闪展腾挪，演变得面目全非，可以说大明官家制度表现出来的种种乱象，都与此有关。朱元璋的权力整顿运动，让人顿生矫枉过正之感，为明王朝的后世之乱埋下了一枚重磅炸弹。
对于这时候的朱元璋来说，他所能体验到的只有两点：一是手中皇权的确够大，二是皇帝的工作负担也的确够重。
《明太祖实录》卷中记载说：洪武十七年（1384年）九月十四日到二十一日，八天之中，全国共有1160件各种文书报告送到朱元璋案头，其中涉及各类事项3391件。平均计算，朱元璋每天需要批阅文件字数约20万字（一本书的容量），处理事务423件。这样的工作量，即便朱元璋五加二，白加黑，不吃不睡，一个小时也要阅读8000字以上，并在20多件国家事务上作出决断。
这种工作量就是放到今天，连我们大学刚毕业的青年人也会感到畏惧，更别说快接近六十岁退休年龄的朱元璋了。就算皇帝个个龙筋虎体，就算他对自己的职业有着无限的热爱，处身于那样一个岗位上也是形同苦役。朱元璋试图找到一个两全其美的办法，既可以解决皇帝工作负担过重问题，又能够使皇权不旁落。
在废除丞相制度之后，朱元璋先是设立了四辅官，称为春、夏、秋、冬四辅官。后来又设置了华盖殿、文华殿、武英殿、文渊阁和东阁等大学士，但这些人的工作能力与先前被杀的那几位丞相，是不可同日而语。另外由朱元璋一手营造出来的恐怖专政的政治氛围，也让这些人战战兢兢无心恋位，他们怕的是一觉醒来就赴了黄泉。
在朱元璋看来，在帝国的权力系统制造那些大案、要案并非常态，只是一时权宜之计，他宁愿由自己来当这个罪人，为子孙“拔刺”，他希望帝国的车轮能够纳入正常法治的轨道。
无可否认的是朱元璋推行的权力整顿，带来了吏治清明，权力监督也较以往到位。但是如何设置皇帝辅政机构的问题，始终没有得到有效地解决。作为开国之君，朱元璋只有无奈地把这个难题留给自己的后世子孙，而在这期间官家权力结构经历了一个非常漫长的嬗变过程。
洪武三十一年（1398年），朱元璋带着这个遗憾离开了这个世界，按照他生前的安排，他的皇长孙朱允汶即位，是为建文帝。
