十三世达赖时期，藏医学也有一定的发展。除开展医疗活动和整理古代藏医学文献外，医学教育也得到高度的重视。大约在1916年，著名医学大师钦饶诺布建立一个医学和天文历算机构“门孜康”，意为“医学历算部”，专门培养藏医学和天文历算的人才，编制藏族年历。学校十分重视学以致用的教学方法。要求学生能辨认200种以上的藏草药，能说出其产地、性味和医疗作用。课堂学习以《四部医典》为主，有严格的考试制度，全部学习达六年之久，学生最多时达150名。
五、新生时期
尽管藏医学在西藏地区有其形成和发展的历史，在不同时期也曾兴盛一时，取得一些成就。但在一个旧的、政教合一的封建农奴制社会里，这些成就，主要是为上层统治阶级服务的。中华人民共和国建立后，这种情况得到彻底的改变。一方面，藏族聚居地区的“门巴扎仓”（藏医学校），都逐步改造成现代藏医教育和医疗机构；另一方面，还新设了一些藏医医疗、教育和研究机构。如“门孜康”扩建为西藏自治区藏医院，分住院部和门诊部，是一所大型的、设备现代化、藏西医相结合的医院。西藏、甘肃、青海、四川、云南等藏族较集中的地区，还设有大专性质的藏医药学院或系，还有藏医中专学校和科学研究机构。仅西藏自治区藏医药人员就从1959年的800人发展到1989年的1500多人。教育机构由藏医培训班到藏医学校、藏医系乃至藏医学院，学生最多时达到348人，先后为本区及区外培养藏医人才1000人以上。仅自治区藏医院现在每年诊治病人就达26万人次以上。其附属药厂每年生产藏药达20万斤。其中珍珠七十、然纳桑培、常觉等藏药，均获国家不同级别的奖励。科研工作主要根据青藏高原自然环境的特点，以防治常见病、多发病为主，取得不少成果。如藏药治疗萎缩性胃炎获中国卫生部科技进步三等奖；《四部医典系列挂图全集》（藏汉、藏英版）获中国图书奖和自治区科技进步一等奖等。此外，还整理出版了《月王药诊》《四部医典》《晶珠本草》《祖先口述》《蓝琉璃》等古医籍，并新编各种藏医药书籍《藏药标准》《新编藏医学》《中国医学百科全书·藏医学》《藏族历代名医略传》等。
近一个世纪以来，藏医已经成为国际藏学界研究的重点之一。被西方称为藏学研究创始者的匈牙利人乔玛，最早向西方介绍《四部医典》。从此，西方逐渐兴起一门藏学研究，藏医是其中的重要组成部分。西方研究藏医，不论在理论还是医疗方面，都发展很快。有不少国家设有藏医研究所及学术团体，专门研究藏医理论，整理文献以及从事临床研究，如设在印度达姆萨拉的藏医研究所，锡金的纳姆嘉尔藏学研究所等。美、英、法、德、瑞典、匈牙利等国的一些大学，也有研究藏学的计划。印度还出版了一种不定期的刊物《西藏医学》，这是世界上惟一的英文藏医学刊物。国际上以各种文字出版的藏医著作已有数十种之多，研究藏医珍贵的彩色挂图“唐卡”，更是一个热门科学。前苏联已经将整套挂图中的77幅的内容译成俄文出版，还计划出版英、法、德等文版。美国、瑞典及印度也都收藏这种“唐卡”。联合国教科文组织近年还拨出专款用来研究藏医的“唐卡”。
国际上已召开两次藏医学术会议。一次是1983年由意大利的“佐诚协会应用医学心理学中心”主办，在意大利召开，会议名称为“人-医学-社会”，另一次会议是1986年由英国威尔康医史研究所主办，在伦敦举行，会议名称为“关于中亚文献中所反映的古典藏医学的医学史学术讨论会”，会议还同时举行题为“藏医学中的人体和思想”的展览。展出图书、挂图、实物。
当前国际上还重点研究藏医古代文献，如《四部医典》与印度寿命吠陀医学古典著作《妙闻全集》文献考证比较研究，与《大藏经》中古代医经的比较研究等等。研究者大多有较好的梵文、藏文和其他有关文字的功底，对于藏医学的起源，以及藏医与古印度医学的关系等问题，都有较深入的研究。已有不少国家开始用藏医来治疗疾病。在前文提到的意大利国际藏医会议上，美籍波兰人（祖籍为中国的藏族）巴德玛耶夫研究的“莲花-28”引起与会代表的极大兴趣，据实验室研究，祖传藏药“莲花-28”具有促进人体免疫机能的效力。因此，藏西医结合的工作也取得一定进展。
基本理论
藏医有一套完整的理论体系，有效地指导着临床的医疗实践。藏医的基本理论包括三因学说、人体类型学说、人体解剖及生理、病因学说、疾病分类等内容。
一、三因学说
三因指隆、赤巴、培根（音译）。藏医认为这三者是构成人体的基本要素，各有其生理机能。在正常情况下，它们保持着协调和相对的平衡状态，维持着人体的健康，而当其中某一成分因故偏盛或偏衰时，人体则陷于病态。三者各司其职。
1．隆
意为风，主呼吸。分成五种：①维命隆。位于头顶部，运行于胸、咽、喉部，司饮食吞咽、呼吸、分泌唾液，使记忆力增强，五官清明。②上行隆。位于胸部，运行于鼻、舌、喉等处。其作用是润泽肤色，使发音清晰，精神振奋。③遍行隆。位于心脏，遍行全身各个部位，使四肢能举动，行走屈伸自如，口鼻开合灵活，并司理语言和思维。④等火隆。位于胃脘部，运行于内脏器官。作用是消化食物，把食物分解为精华和糟粕，使血液生成。⑤下泄隆。位于肛门，运行于大肠、膀胱、阴部及大腿内侧。它管理男性精液、女性月经及大小便的排泄、产妇的分娩等。
2．赤巴
意为火，主身体之热能。分成五种：①能消赤巴。存在于胃肠。能把食物分解成精华和糟粕，增加身体的热力，并协助其他四种赤巴保持正常的机能。②变色赤巴。存在于肝脏。其功能主要是使血液、胆汁、肌肉和骨骼等保持自己的颜色。③能作赤巴。存在于心脏。它支配意识，使人有胆识谋略，使人骄傲并产生欲望。④能视赤巴。位于眼部。使人眼能视物，主司人的视觉，并使人能辨别客观世界的各种颜色。⑤明色赤巴。存在于皮肤。使人的皮肤色泽鲜明而润泽。
3．培根
意为水和土，主体液。分成五种：①能依培根。存在于胸中，是最重要的一种。能协调使其他四种培根保持正常，调节全身水分，使其保持适量。②能化培根。存在胃之上部，食物未经消化的部位。主司食物磨碎和腐熟。③能味培根。存在于舌部。主司人的味觉。④能足培根。存在于头部。主司眼睛等器官的发育，也使人的欲望满足和知足。⑤能合培根。存在于所有关节处。其作用为主司骨与骨之间相互联接，使之能屈伸自如。
隆、赤巴、培根三者的关系是互相依存、互相制约、互相协调以维持人体的正常机能，使其成为整体。例如，对食物的正常消化、吸收，分清糟粕和精华，需要有能化培根、能消赤巴和等火隆三者共同完成，如果三者不协调，消化吸收就会受阻，以致引发疾病。
二、人体类型学说
藏医把人体按隆、赤巴、培根分成三种类型。隆有粗、轻、寒、微、硬、动六种特性，隆型人体型干瘦、背曲、面色偏青灰、多话、不耐寒、睡眠不踏实、体格矮小、喜唱歌与嬉笑、喜争论、嗜甜酸苦辣味和具有老鹰、乌鸦、狐狸般的性格。赤巴有腻、锐、热、轻、臭、泻、湿七种特性。赤巴型的人体型高、身有臭味、易渴不耐饥、头发及肤色偏黄，聪明而骄傲；嗜甜苦涩凉味和具有猴子、老虎般的性格。培根有腻、凉、重、钝、稳、柔、黏等七种特性。培根型的人较肥胖、肌肉丰满、肤色偏白、体型端直、耐饥渴和烦恼、嗜睡眠、嗜酸涩辣等，其性情善良，具有狮子般的性格。
有些人属混合型，有两种类型的混合性格。如隆、赤巴混合型者身体较小，培根、隆混合型者身体中等，培根、赤巴混合型者身体高大，其性格、行为、嗜好等则兼有两者之特点。判定人的类型，与用药治病的关系极为密切。
三、人体解剖及生理
由于民族习惯及民俗关系，藏医对于人体解剖及生理有比较深入的了解。在内脏构造方面，也认为有五脏：肝、心、脾、肺、肾；六腑：胆、小肠、大肠、膀胱、胃和“三木休”（类似中医的“三焦”）。而且对骨骼关节、脑髓神经等，都有一定的认识。对于胚胎学的认识，在世界医学史上也占有一定地位。例如，藏医典籍中已认识到，人胚是由父精与母血所结合，逐渐发育而成的。胎儿从母体吸收营养，犹如水库通过水渠（脐带）向庄稼（胎儿）灌溉一样。在发育过程中，胎儿不断发生变化，并且要顺序经历与鱼、龟、猪相似的几个时期。这些认识基本与现代研究结果相吻合。
藏医还认为人体是由七种物质构成的：即精微（来自食物）、血液、肌肉、脂肪、骨骼、骨髓和精液。这七种物质在体内有各自的功能，如精微是人体的营养物；血液维持生命，肉保护内脏，骨是支持全身的框架，髓则可变为精液，精是生殖繁衍不可缺少的物质。
藏医认为，人体内的三大因素，七种物质、三种排泄物等，在正常情况下都有一定的量，互相之间保持协调，一旦这种协调关系受到破坏，发生偏盛或偏衰，都会导致疾病。
四、病因学说
藏医也认为产生疾病的原因包括内因和外因两种。在内因方面，涉及人的体质类型、年龄、情绪变化等因素。各种过激的情绪，不论喜怒忧思，均可致病。在外因方面，包括气候变化、起居环境、饮食不节等因素，并特别强调起居环境和饮食。凡居住环境过于潮湿寒冷或过热，过食与体质类型不相匹配或相悖的食物，以及偏食嗜味、暴饮暴食、误食毒物、酗酒等均可致病。另外，如强忍二便、强忍射精、久卧久坐、房事过度、失血过多，以及外伤、虫豸蜇伤等，都是造成疾病的原因。
医疗实践
一、诊断辨症
诊断方法包括望诊、问诊和触诊（脉诊）。
1．望诊
内容较广，如观察病人的神情、气色、动作、喘息等，但其重点主要是舌诊和尿诊。舌诊观察舌质的老嫩肥瘦和色泽，舌苔的有无、厚薄和质地等。尿诊则是具有藏医特色的诊断方法之一，其观察的内容包括尿量、尿色、尿的沉淀物、气味、泡沫的有无与性质、尿中的漂浮物、蒸气逸出情况。通过尿诊，即能提出疾病的诊断，并判断其预后。
2．问诊
与一般医学体系的问诊基本一致，包括的内容也较多，如问现在病症的起因经过，发病缓急，病程变化，环境及气候因素，饮食起居，用药及治疗情况，家庭病史等。
3．脉诊
藏医的脉诊与汉族医学的脉诊相似。切脉的部位在腕部桡动脉，用三个指头按住寸、甘、恰三个部位，分别诊候心脏和小肠、脾和胃、肾和“三木休”（左手），肺和大肠、肝和胆、肾和膀胱（右手）等脏器的状态。藏医认为心脉与舌相联系，肺脉与鼻相联系，肝脉与两目相联系，脾脉与口唇相联系，肾脉与两耳相联系。当某一脏腑有病时，其相应的五官也会有病态出现。如心脉有病，则舌缩语艰；肺脉有病，则鼻翼下陷；肝脉有病，则两目上吊；脾脉有病，则口唇下垂；肾脉有病则两耳失聪或耳轮枯槁。藏医能区别20多种脉象，但其中较常见的12种脉象，对于鉴别病症的寒热，关系重大，而藏医一般辨症也总是着重辨别病症的寒热。例如，热证脉多数、洪、大、弦、滑、硬；寒证脉多沉、迟、弱、细、浮、虚。藏医对诊脉的要求也较严格，认为清晨刚睡醒，晨曦微露的时刻，所得脉象最能反映人体真实情况。认为医生一呼一吸之间脉跳5次为正常；而每次诊脉，至少应达100次，才能判断节律的均匀、快慢。诊脉还应区别四季的不同，因为脉象在不同季节有相应的变化。此外，藏医还运用五行生克学说来解释脉象。
二、治疗方法
藏医治疗疾病有多种方法，其中以饮食疗法和药物疗法最为常用。
1．饮食疗法
对患者应吃哪些食物、忌食哪些食物，都有严格规定。四季饮食也有所不同。例如，患赤巴病，可食野牛肉、鱼、羊肉、蜂蜜；春季宜食苦辛涩三种味的食物，如陈青稞、干燥地区的畜肉、蜂蜜、开水、姜汤等食物。又如隆病宜食大葱、大蒜、羊肉、马肉、驴肉、红糖、陈酥油、黑芝麻油、热糌粑、白酒、牦牛奶等。
2．药物疗法
分内服、外用两种。藏医认为，药物有六味、八性、十七效的区别。六味即甘酸苦辛咸涩；八性为轻、重、寒、热、锐、钝、润、燥；十七效为寒、热、温、凉、稳、动、轻、重、润、干、燥、稀、钝、锐、细、腻、软。治病时，需针对疾病的特性采用药效相对的药物。如隆病的特性为粗、轻、硬、动，治疗宜用细、重、软、稳等药效的药物。
除了饮食疗法、药物疗法外，藏医还有许多其他疗法，包括用器械外治、放血疗法、艾灸疗法、拔罐疗法等多种外治疗法。此外，藏医还十分重视起居生活与各种疗法互相配合。
