已建立的城关一区，梅仙二区，西洋三区，溪尾四区，坂面五区，新桥六区等6个区公所，都相应地成立“剿匪指挥所”。其任务：剿匪部队提供匪情，保障部队供给；负责动员并指挥各乡村民兵，配合部队行动。县区乡三级政府，都要在人财物等方面，保证剿匪工作的需要，都要把剿匪斗争做为一项中心工作任务完成好。
在各乡村里，组建民兵队伍。动员青壮年农民，自动报各参加民兵组织。到1950年10月，全县97个乡村，都建立了民兵队伍和自卫队组织，参加民兵人数达4656人，参加自卫队人数有8289人。他们从地主武装手中收缴来的和上级政府发给的枪支弹药，在民兵手中拥有的各种枪支达2000多支，以及一批子弹、手榴弹。
新组建起来的民兵队伍，人人都有一种当家做主的自豪感和责任心，满腔热情、斗志昂扬地投入到剿匪斗争中去。他们提出“一手拿锄，一手拿枪，消灭土匪，保卫家乡”的响亮口号。做到白天带枪到田头，有匪情时，放下锄头，拿起枪杆，追剿土匪，参加生产，保卫生产；夜间护村防哨，自卫联防，检查过往生人，严防止匪袭击。
当剿匪部队来到时，各乡村民兵大力配合，为部队带路，提供情报，帮助捉拿散匪，押看俘虏；为部队筹集粮食、畜禽蛋、蔬菜、紫菜等物资，做好支援工作。并且同部队并肩战斗。据统计，全县民兵协同部队剿匪达208次，独立剿匪201次，广大民兵在剿匪斗争中，起到关键性作用。
8月，匪首王济成，带着40多个匪徒，两次袭击四区溪滨村，民兵队长林旺高，带领兵独立作战，第一次在村水尾路边山上伏击土匪，打了一次漂亮战，打死匪徒1人，缴获步枪1支，子弹60多发，土匪狼狈逃窜；在第二次土匪进村时，林旺高带领几位民兵，利用坚固的土堡，与土匪对峙了一天一夜。他为了保护人民的生命财产安全牺牲了自己的妻子等待区武装队伍的到来，又一次打退了土匪进犯。
二区梅营村民兵队长华德荣，响应上级政府号召，带头在村里组建起一支民兵队伍。在区武工队的支持下，经常带领民兵独立作战，消灭土匪。当剿匪部队到来时，他更是积极配合，协同作战。村民兵队伍建立后的头10个月，民兵独立作战35次，与部队协同作战16次，消灭土匪60多人。
1951年10月26日，全县民兵代表大会召开，有250位民兵代表参加。大会总结了前一看在剿匪斗争中的成绩与经验，评选出华德荣、林旺高等97位民兵模范，奖励给全县民兵先进单位步枪33支，手榴弹60枚。
宣传群众瓦解股匪
剿匪斗争，与论先行。县委、县政府，向全县人民发出“全民动员，团结一致，配合部队，剿灭土匪，建设家园”的号召。召开全县第一届各界人民代表大会，全面部署清剿土匪的各项工作。采取多种形式，宣传发动群众，提高群众对剿匪斗争的思想认识，并且及时地把群众的积极性引导到剿匪计算中来。
开始时，群众对剿灭土匪，普遍持有怀疑态度，怕土匪人数多，窜犯时间长，地熟人通，消灭很困难，没有信心，担心剿匪不彻底，部队一走，土匪又会捲土重来，打蛇不死，反被蛇咬。针对群众的思想顾虑，县委、县政府，以南下来的干部为骨干，与地方上的区分干部相结合，组成工作组，深入到全县各乡村。开展以剿匪斗争为中心的，宣传减租、反霸、土地改革等党在农村的各项政策，鼓舞群众，调动群众的积极性。同时，通过访贫问苦，在各乡村组织起农民协会，通过农会组织，动员群众，共同做瓦解股匪工作。全县上下，团结一心，全力以赴，使得股匪陷入到人民战争的汪洋大海之中。
同时，通过贯彻中央关于《惩治反革命条例》，发动群众申冤诉苦，深挖在地方上的地主、恶霸、反革命分子，对其中罪大恶极，有现行破坏活动的，开放公审，坚决镇压，震慑了敌人，提高人民群众对剿匪斗争的信心和决心。
对土匪及其匪属，开展政治攻势，向他们讲明党的“坦白从宽，抗拒从严，主动受奖”和“首恶必办，协从不问，带枪投诚者宽大”的剿匪政策，叫他们认清形势，丢掉幻想，自动下山，向人民政府投诚自新，争取宽大处理。
县长李生旺，冒险深入到当时土匪活动猖獗，群众工作相对薄弱的管臆乡，宣传发动群众，做匪属工作。还利用在地方上有影响、有声望的民主人士、开明绅士，配合政府，做匪属的说服教育工作，再通过匪属，动员他们在山上为匪的亲人下山，向政府悔过自新，起到很好的瓦解股匪作用。
抚剿并用感召多数
根据土匪的罪恶大小，认罪悔过态度，区别对待，适时兑现党的“坦白从宽，抗拒从严”政策。对自动下山向政府悔过自新的一般匪徒，经过对他们的教育后，当场释放，让他们早日回家，并且鼓励他们，放下包袱，积极投入到生产建设中去；对被抓俘的匪徒，其罪恶不大，对他们进行集中教育，促使他们悔过自新，低头认罪后，也都及时放他们回去；就是对被抓俘的土匪头子，也要讲究政策，区别对待。只要不是顽固不化，有改造希望的，尽量做到不杀或少杀。比如，第一个被杀的土匪头子陈友梓，也是经过“三擒三纵”之后，到第四次被抓时，才对他处以极刑的为了扩大影响，震慑顽徒，县人民政府于8月30日，召开千人群众大会，对死不改悔的土匪头子陈友梓公开审判，执行枪决。同时，对有改编改表现的匪中队长林尚义，当场释放，兑现宽大政策。
经过强大的政治攻势，抚巢并用，起到震聂匪首，瓦解股匪的作用。对于仍在负隅顽抗的残匪，坚决予以围歼。10月初，蔡主纲匪首，率其残部23人，负隅顽抗，被剿匪部队围歼，打死5人，大部被活提，缴获枪支21支。仍坚持在山上的卢有乾股匪，被包围在清源乡山上，被击毙3人，活捉多人。从大田流窜到尤溪的惯匪陈伯森，德化匪大队长王虎，分别被剿匪部队，包围在三区后坪坑和五区街面，有的被击毙，有的被活捉，其残部抱头鼠窜，狼狈出境。这时，潜伏在三区桂峰村山上，仍抱有幻想的股匪吴庆卿，受到震慑，率领他的残部78人，携带长短枪45支，子弹一千多发，缴械投降。吴正标、王济成等匪首，也都纷纷率领他的匪徒下山缴械投降。从9月到11月之间，绝大部分股匪都被逼投降。被击毙的匪首肖子法等股匪，也是树倒猢狲散。匪徒们一个接一个地向人民政府悔过自新。
由于时间集中，人数众多，一时间，县里监狱人满为患，关押不下，只好借用附近民房做牢房，关押犯人。据统计，在被清剿的款项总数中，约占百分之七十左右，是他们自动投降自新的。
至此为止，长期流窜在尤溪县境内的大小股匪，已基本肃法，最后剩下的只有吴曲九、洪钟元、陈玉麟等三股土匪了。
重点围剿干净彻底
剿匪指挥部分析认为：经过几个月的剿匪斗争，在尤溪县境内的土匪已基本肃法。仍坚持在山上的吴曲九、洪钟元、陈玉麟三个匪首，他手下的中队长、分队长及其匪徒的大多数，也已陆续下山投诚自新。仍盘踞在山上，跟随他们三人身边的人数虽然不变，但其思想极端反动，顽固到底，危害性仍然存在，应采取“重点打击，各个歼灭”的办法，集中兵力，重点清剿，迅速予以歼灭。
