警察来了之后，发现这个社长是中了氰酸钾的毒身亡的。接着目暮警官又问了几个社员和天羽他们，得知社长是在吃了汉堡后毒发的。
目暮：“那么，那个汉堡是谁买来的？”
一个长发络腮胡子的男人回应道：“是我……”他是姓夏堀的一个社员。
“那也就是说你最有机会下毒喽？”
夏堀：“请等一下……社长可是自己挑的汉堡，汉堡都是同样口味的！”
这下警方又怀疑是在社长平时用的工具上下毒，问了下社长的办公位置，正好就在今井先生座位的旁边，“要瞒过社长下毒最方便的就是今井先生吧？”目暮又怀疑起今井来。
今井说他的确最有可能，但社长在吃汉堡之前还吃了他从厨房拿来的曲奇饼干，要是工具上有毒，那吃曲奇时社长就应该会毒发。
“嗯？这是什么？”目暮警官拿起社长桌上的一个药瓶问。
夏堀：“那是泻药，社长有很厉害的痔疮，所以经常喝这个。”
今井：“不过经常吃的太多把肚子吃坏了……”
“尤其是最近，经常有……”夏堀附和道。
接着今井又提到社长在吃汉堡前还去过厕所，因为拉肚子。目暮又问谁在社长之前进过厕所，今井和夏堀都说是财津先生去小便过。
财津反驳道：“我是在社长之前去过，可我不是社长进之前的最后一个去的…”他回头指着天羽他们，“这三个孩子才是啊……”
高木惊道：“这不是柯南吗？还有天羽、阿笠博士和小哀……怎么也会在这里？”
天羽顿时无语，敢情我们在这儿站了这么久，你才知道我们的存在吗？
“你们好像经常被卷进这种事…博士你和毛利越来越像了啊……”目暮吐槽道。
高木：“那么你们是谁先进去的？”
被这么一问，柯南有点尴尬，只有天羽和灰原异口同声的说：“是同时……”
“哈？三个人一起上厕所？”
柯南连忙解释：“那个…其实是我把零钱掉在什么地方了，就三个人一起去找了对吧？”
灰原：“是啊……”
见灰原若有所思的盯着自己的胸口，天羽知道她是在看风衣内兜的录音带，“小哀，你就别看了，一会儿回去的时候我就给你。”
“那…你说这里面的是什么内容？”灰原好奇的问。
“我也不清楚，你一会听了不就知道了？”
之后柯南提议警方查一下工作室到厕所之间的地方，如果下毒应该就是在这些地方了。不过结果却出人预料，并没有任何毒物反应。
高木：“奇怪的是，被害人裤子右侧和皮带空着的洞上却有毒物反应，还有其左手指尖、手帕和汉堡包装纸上都有。但这些地方的毒物含量都很少，恐怕是被害者手碰的地方。”
接下来他又汇报了在厕所抽水用的板手左边有毒，如果是在去厕所之前左手就沾上毒药，那么穿裤子时毒应该沾在左边才对，可事实是右边裤子有毒。
柯南听罢便问那三个社员：“社长先生平时有什么习惯吗？比如左撇子。”
结果没有得到他想要的答案，只有社长爱干净和咖啡通两个特点。
“那么有没有发现什么可疑的人在监视这里？”灰原突然问道。
夏堀：“没有…只有两次被窃，其他倒没什么……”
目暮让他讲清楚一点，但夏堀说只知道窗户的锁被撬开了。
博士在把小哀拉到一旁，蹲下来问：“小哀，难道说这次犯罪是……”
“是啊…不留任何证据，抹杀目标人物，如同在迷雾中隐藏自己的形迹……很像那些家伙的一贯作风，姐姐来过后发生的盗窃应该就是他们所为……”
柯南和天羽也认同这一点，柯南分析他们是来查探她是不是在这儿藏了什么…厕所中也有被装过窃听器的痕迹，恐怕是第一次来时没找到就先装上窃听器，然后从这个研究所的人们的对话中判断没有隐藏的东西，第二次潜入时，再把窃听器回收，应该就是这么回事。
但是柯南并不认为这次的杀人案也是他们干的，毕竟这社长已经和宫野博士三十年没见面了。
可灰原却说：“目的是我……如果他们预想我会来这里，于是就杀害了爸爸的朋友，打算从精神上压迫我…如何？”
天羽：“如何？当然是扯淡喽，你在这之前根本都不知道出岛社长是谁，组织从你记事起就监视着你，居然会觉得杀一个你不认识的人会压迫到你？”
灰原也发现自己好像有点想当然了，正准备说什么时，又被天羽抢先了，天羽继续说：“而且…小哀你也太看的起自己了吧？组织现在有玛格丽特接替你的工作，不会再把你看的那么重，怎么会因为你而去杀这个社长，要是针对我还差不多。”
这话说的灰原有些生气，总感觉自己被小看了，她并没说啥，只掐了一下天羽的腰，天羽痛的向一边闪开，“小哀你怎么这样？我说的是实话啊。”
“我没说你说的是假话啊？不过……我感觉到了……”
柯南：“感觉到什么？”
“是不是在杯户商厦那时，有被监视的感觉？”天羽仿佛能猜到她在想什么似的。
灰原苦笑道：“是啊，在渐渐消失的意识中……好像蔑视我似的冰冷的视线……”
“那你干嘛来这里？明知道外出很危险…”柯南质问道。
灰原回答说是因为她想知道自己的父母是不是真的像组织里传说的那样…特别是在见了柯南妈妈那么阳光之后，可是像传闻一样，疯狂科学家的爸爸先不说，妈妈好像是个沉默阴沉，不知道在想什么的人。
柯南反驳说那只是传闻而已，不能妄下结论。
灰原：“你知道吗？妈妈在组织里被称做什么？堕落在地狱中的天使。”
“那个是别人的误解罢了，不过说是堕入地狱的天使也没错，字面意思！”天羽笑着说道。
灰原：“是吗？如果真是那样就好了，不过……”灰原凑近天羽说道：“你那个笑…怎么感觉怪怪的，是不是……想你的妈妈了？你之前在组织搞那么大动静就是想为她报仇。”
“你知道了还问？”
灰原：“好了，我不提总行了吧，不管怎样你还是比我幸福一点点……”
