崇祯四年,即后金天聪五年(1631年),后金军围攻大凌河城急,明登州(今蓬莱)巡抚孙元化遣参将孔有德率水师赴援。兵至登州城西之吴家桥时,孔有德叛明兵变,率兵攻打山东各州县,陷陵县、临邑、商河,围德平,陷青城(今高青西)、新城(今桓台县)。山东巡抚余大成派兵抵御,战败。叛军长驱登、莱二州。明政府命刘宇烈督兵讨伐孔有德。刘宇烈集中保定、天津、山东、蓟州、四川等地二万五千精兵于昌邑,进军至沙河,其部队辎重被叛军焚毁而退走青州,其他各路官军也都败走。七月,天津归将孙应龙率水师三千由海道至登州水城,叛军将其诱杀,得其船舰,乘势破招远、围莱阳。孔有德又用伪降之计诱俘登、莱巡抚谢琏、知府朱万年等。八月,明以朱大典巡抚山东,率兵救莱州。孔有德战败,莱州解围。明军乘势追击孔有德于黄县,杀叛军一万三千多人,俘八百人。孔有德逃回登州,明军即围困登州。叛将李九成率众出击而战死。孔有德企图弃登州城入海退走,明军派龚正祥等率领舟师四千在海口阻击,但正遇上飓风,船被风刮破,叛军乘机俘龚正祥,杀千总毛英。崇祯六年二月,明军参将王元富、祖宽等夺占登州水门外护墙。孔有德、耿仲明入海逃走。明军用火药炸毁城墙而入,俘叛军千余人。山东叛乱被平息。孔有德、耿仲明降金。
崇祯六年,因萧筠庭屡立战功,徐天盛奏明天子将其破格提拔为副将,让他领5000精兵来登州府增援布防,搜剿孔有德残部,追歼余党。登州府东、北、西三面环水,向东可入海,府东设立温泉巡司向西也可入海,府西设有东良巡司;向南则可到莱阳县。登州府所在地为蓬莱,蓬莱、福山、黄县、栖霞、莱阳、招远、宁海州、文登8州都在登州府的管辖下。登州府境内在不同的地方设立了相应的管理机构,如温泉巡司、高山巡司、杨家巡司等。
登州府有四个门,东面是春生门,南面为朝天门,西面是迎恩门,北为镇海门,四门成为了进出登州府的主要通道。一条中轴线从东门贯穿而入,进入东门,向左边看去,一座古朴的庙宇横卧在那里。左面的建筑较少。顺着右手边看去,先是有普照寺,在它的后面是预备仓、养济院、土地庙。沿着中轴线直着走,不久一座小巧的弯弯河桥横卧在蜜水河上,这座桥也因水得名,名为蜜水河桥。下了桥,沿着通道向西走,这时可以看到,通道的右边一座小小的后土庙静静地立在那里,再接着走就是蓬莱县了。
通道的左边有一条海运道,这条路上平时很是热闹,来来往往的商人迈着轻快的步伐,小商贩一边吆喝着一边看着匆匆行走的商人。顺着通道继续走,路过钟楼、书院,钟楼后设有登州卫,登州卫北面传来了朗朗的读书声。接着走,路左右两边分别有万寿宫、军器局和文昌祠可就这样,一路散漫到了黑水河画桥,这黑水河水并不黑,也不知怎么得了个黑水的名字。过了黑水河画桥,沿着通道继续前行,右边是龙王庙,当时的登州人经常来这里祈祷。接着到了鼓楼,路过按察司,就到了登州府,登州府在通道右边,距离迎恩门不是很远。登州府衙对面有通道,通道左边是府学、税课司、观音堂,右边建筑很多,有大东书院、学堂、关帝庙、布政司、城隍庙、开元寺等。
追歼余匪的任务完成后,萧筠庭又奉命长期驻守登莱,以防不测。
无聊的萧筠庭只好整日游山玩水,消磨时光,暂表不提。